Título
Sesgo en la estimación de efectos de QTLs en experimentos de retrocruzas.
Autor
ANA LAURA TORRES RAMÍREZ
Colaborador
MANUEL HUMBERTO REYES VALDÉS (Asesor de tesis)
OCTAVIO MARTÍNEZ DE LA VEGA (Asesor de tesis)
MARIO CANTU SIFUENTES (Asesor de tesis)
JOSE REFUGIO REYES VALDES (Asesor de tesis)
Nivel de Acceso
Acceso Abierto
Resumen o descripción
"Un problema asociado con la metodología en las investigaciones de QTLs es el sesgo en la estimación del número y efecto de estos. Esto se hizo evidente cuando fue reportado por Beavis (1994). El objetivo del presente estudio fue evaluar el sesgo en la estimación de los efectos de QTLs bajo diferentes condiciones experimentales en mapeo de regresión por intervalos en retrocruzas. Para realizar lo anterior se trabajó con tres factores experimentales: tamaño de muestra (100, 200 y 300), heredabilidad (10 y 5 por ciento) y número de marcadores (2, 4 y 6) . Se estableció un grupo de ligamiento de 100 cM donde se distribuyeron uniformemente cada una de las diferentes densidades v de marcadores y con la combinación entre este factor con heredabilidad y tamaño de muestra se obtuvieron 18 diferentes condiciones experimentales. Con la utilización de simulaciones se generaron los datos para la presente investigación. El análisis de los datos se llevo al cabo a través del programa SATORI (Reyes, 2003). El análisis de los resultados indica que existe una tendencia a sobreestimar el valor absoluto de los efectos de los QTLs y que la magnitud del sesgo está estrechamente relacionada con las condiciones experimentales y la heredabilidad del QTL en cuestión. Desde el punto de vista puramente estadístico, el sesgo obedece a una correlación positiva entre el valor estimado del efecto y el valor del estadístico de prueba; esto acoplado a la regla de decisión que selecciona valores altos de dicho estadístico, a fin de declarar la presencia de un QTL."
"A problem associated whit the methodology on QTL research, is the bias on the estimation of numbers and effects. This was clearly evident when Beavis (1994) reported it. The goal of the present study was to evaluate the bias on the estimation of the QTL effects under different experimental conditions by regression interval mapping in backcross populations. Three factors were considered: sample size (100, 200 and 300), heritability (10 and 5 percent) and markers density (2, 4 and 6). A linkage group of 100 cM was established with markers uniformly distributed. The combination between this factor with heritability and the sample size gave 18 different experimental conditions. Simulation was used to generate the data for this investigation. Data analysis was performed using the program SATORI (Reyes, 2003). The data analysis indicates that there is a tendency to estimate over the absolute value of QTL effects and the bias magnitude is closely related with experimental conditions and heritability of the QTL. From a pure statistical point of view, the bias obeys to a positive correlation between the estimated value of the effect and the value of the test statistic coupled to the decision rule of selecting the high valves of that statistic, with the object to establish the presence of a QTL"
Fecha de publicación
octubre de 2004
Tipo de publicación
Tesis de maestría
Versión de la publicación
Versión publicada
Recurso de información
Formato
application/pdf
Idioma
Español
Audiencia
Estudiantes
Investigadores
Repositorio Orígen
Repositorio Digital CID-UAAAN
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