Título
Variabilidad genetica y patogenica de phytophthora cinnamomi rands en Michoácan México
Autor
YISA MARIA OCHOA FUENTES
Colaborador
ALBERTO FLORES OLIVAS (Asesor de tesis)
FRANCISCO DANIEL HERNÁNDEZ CASTILLO (Asesor de tesis)
JERÓNIMO LANDEROS FLORES (Asesor de tesis)
VÍCTOR OLALDE PORTUGAL (Asesor de tesis)
EUGENIO GUERRERO RODRÍGUEZ (Asesor de tesis)
Nivel de Acceso
Acceso Abierto
Materias
Resumen o descripción
"El trabajo de investigación se realizó en la Universidad Autónoma Agraria Antonio Narro en Saltillo, en el Centro de Investigación y de Estudios Avanzados (CINVESTAV-IPN) Unidad Irapuato y el Centro de Ciencias Químico Biológicas de la Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo en el periodo de Marzo del año 2003 a Julio del año 2005. Teniendo como objetivo determinar los grupos de compatibilidad sexual, variabilidad genética, y patogénica de aislados de Phytophthora cinnamomi Rands obtenidos de la región productora de aguacate de Michoacán, México. Se determinó la presencia de los grupos de compatibilidad sexual A1 y A2 de P. cinnamomi, en 25 aislados obtenidos de cinco localidades del estado de Michoacán, México. Los aislados se confrontaron en medio jugo V8-agar clarificado, se determinó la producción de oosporas. Se identificó el grupo de compatibilidad sexual A1 mediante PCR, usando el iniciador OPS-13, el cuál amplifica una banda de 2.7 kb. Se identificaron seis aislados como grupo de compatibilidad sexual A1 y 19 aislados A2; sin embrago de los aislados A1, solo uno produjo oosporas al confrontarse con el restos de los aislamientos. Una vez determinados los grupos de compatibilidad sexual, se realizó un segundo muestreo obteniendo 42 aislados, a las cuales se les determinó variabilidad genética utilizando polimorfismos de ADN amplificados al azar (RAPDs) y polimorfismos de la longitud de los fragmentos amplificados (AFLP). En RAPDs, se utilizaron 21 oligonucleótidos de 10 bases, los cuales mostraron un total de 23 bandas. Para AFLP, las amplificaciones mostraron 296 bandas; el análisis en ambos casos consistió en la obtención de la matriz de disimilaridades genéticas utilizando el coeficiente de apareamiento múltiple y el método del promedio no ponderado, para la obtención del dendograma. Los aislados se clasificaron dentro de dos grupos principales; asociados con la localización geográfica de la cual fueron obtenidos los aislados. El análisis y la determinación de los niveles de confianza muestran que estas agrupaciones geográficas son extremadamente fuertes. Se seleccionaron ocho variantes genéticas de P. cinnamomi, obteniendo el inóculo a partir de cepas en crecimiento activo en medio de cultivo V-8 agar clarificado. inoculando nueve plantas de aguacate, con cada una de las variantes genéticas y las plantas testigo fueron tratadas con agua destilada estéril. Se determinó la incidencia y severidad de la enfermedad, esta última en base a la escala propuesta por Zentmyer (1984). Los datos fueron analizados por medio del análisis multivariado utilizando el programa SAS (Statistical Analysis System). Las pruebas de medias fueron realizadas por Tukey al 0.05. La incidencia de P. cinnamomi en las plantas de aguacate, presentó diferencia significativa en la cepa C4 con respecto al Testigo. Referente a severidad, de acuerdo al análisis se obtuvo que las cepas C6 , C7 y C8 provenientes de Uruapan y Peribán murieron al final del experimento; mientras que las cepas C3, C4 y C5 presentaron solamente daños severos y las cepas C1 y C2 de Salvador Escalante ambas presentaron un daño moderad; por lo que este estudio demostró la variabilidad genética y patogénica que presentan cepas de Phytophthora cinnamomi obtenidas en poblaciones a 60 kilómetros de distancia."
"The research work was conducted at “ Universidad Autonoma Agraria Antonio Narro” in Saltillo, jointly with the Research Center of Advanced Studies (CINVESTAV-IPN), Irapuato and the Center of Biochemical Sciences of “Universidad Michoacana de San Nicolas de Hidalgo” from March 2003 to July 2005. The purpose of this work was to determine the sexual compatibility groups, as well as the genetic and pathogenic variability of Phytophthora cinnamomi Rands’ isolates, obtained from Michoacan, an avocado producing region in Mexico. The presence of the sexual compatibility groups A1 and A2 of P. cinnamomi, was determined in 25 isolates obtained from 5 different localities of Michoacan state, Mexico. The isolates were challenged in V8 juice- clarified agar culture medium. The oospores production was determined. A1 sexual compatibility group was identified using PCR and the initiator OPS-13, which amplifies a band of 2.7 kb. Six isolates were identified within sexual compatibility group A 1, while 19 isolates belonged to A2. However in A1, only one isolate produced oospores when being challenged with the rest of the isolates. After the sexual compatibility groups had been determined, a second sampling process was conducted on 42 isolates. Their genetic variability was determined using Random Amplified Polymorphisms of DNA (RAPDs) and Amplified Fragment Length Polymorphisms (AFLP). 21 oligonucleotides of 10 bases were used in RAPDs, showing a total of 23 bands. In AFLP, the amplifications showed 296 bands. The trial in both cases used the genetic dissimilarity matrix by means of the multiple coupling method and the non-weighed average methods, to obtain the dendogram. The isolates were classified in two main groups that were associated with the geographical location from which they were obtained. The analysis and determination of the confidence levels demonstrate that these geographical groupings are extremely strong. Eight genetic variations of P. cinnamomi were identified from the inoculums obtained from the strains that were actively growing in the V-8- clarified agar culture medium. Nine avocado plants were inoculated with each genetic variation and the check plants were treated with sterile water. Incidence and severity of the disease were determined, using Zentmyer (1984) proposed scale in the severity test. A multi-variable analysis was applied to the data using SAS (Statistical Analysis System). Mean trials were conducted using Tukey’s mean at 0.05. P. Cinnamomi’s incidence in avocado plants presented a significant difference when strain C4 was compared against the check test. The severity analysis revealed that strains C6 , C7 and C8 from Uruapan and Peribam died at the end of the experiment, while strains C3, C4 and C5 showed severe damage only and strains C1 and C2 from Salvador Escalante suffered moderate damage. Therefore, the study demonstrated the existence of genetic and pathogenic variability in strains of Phytophthora cinnamomi obtained from places located at 60 kilometers of distance."
Fecha de publicación
marzo de 2006
Tipo de publicación
Tesis de doctorado
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Formato
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Idioma
Español
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Estudiantes
Investigadores
Repositorio Orígen
Repositorio Digital CID-UAAAN
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