Título
Identificación de genes relacionados a la respuesta hidrotrópica en maíz mediante estudios de asociación del genoma completo (genome-wide association studies, gwas)
Autor
JESUS JONATHAN MARTINEZ GUADARRAMA
Colaborador
DELFEENA EAPEN
Nivel de Acceso
Acceso Abierto
Resumen o descripción
Resumen
Las plantas tienen la capacidad de dirigir el crecimiento de sus raíces hacia fuentes de humedad, este fenómeno es conocido como hidrotropismo y puede ser utilizado como mecanismo de evasión a la sequía, sin embargo este fenómeno es poco estudiado y a pesar de su potencial aplicación se conoce muy poco en plantas de interés agrícola como el maíz.
El objetivo de este trabajo fue identificar genes relacionados a la respuesta hidrotrópica de la raíz primaria de maíz a través de análisis de asociación del genoma completo (Genome-Wide Association Studies, GWAS) en una población de 231 híbridos de maíz DTMA (Drought Tolerant Maize for Africa). El análisis tipo GWAS partió de la fenotipificación de la respuesta hidrotrópica y la identificación de SNPs en la población de híbridos DTMA. A partir de estos datos obtenidos se realizó el análisis tipo GWAS, en el cual se identificaron más de 23 mil SNPs asociados a la respuesta hidrotrópica de maíz. Se realizó la búsqueda de información de los 100 SNPs con la mayor asociación (valor P) a dicha respuesta y fueron seleccionados los genes NRT1.1, EGY3, NPH3 y DUF1005 para explorar sus funciones reportadas y posible participación en la vía de señalización de la respuesta hidrotrópica de la raíz primaria de maíz. A través de PCR tiempo final se identificó que DUF1005 se expresa a 6 horas de exposición a un gradiente de humedad in vitro, y de forma diferencial en híbridos con y sin respuesta hidrotrópica. Interesantemente, el SNP con mayor asociación a la respuesta hidrotrópica de la raíz primaria de maíz se situó dentro del gen DUF1005.
Editor
El autor
Fecha de publicación
28 de mayo de 2019
Tipo de publicación
Tesis de maestría
Recurso de información
Formato
Idioma
Español
Cobertura
MEX
Audiencia
Investigadores
Repositorio Orígen
Repositorio Institucional de Acceso Abierto de la Universidad Autónoma del Estado de Morelos
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