Title

Identificación molecular de bacterias cultivables asociadas a las hojas de arroz (Oryza sativa L.) con síntomas de tizón en el municipio de Escárcega, Campeche.

Author

JOSÉ ORLANDO PUC UITZ

Contributor

ALFREDO SÁNCHEZ VILLARREAL (Thesis Adviser)

Access level

Open Access

Summary or description

Tesis (Maestría en Ciencias, especialista en Bioprospección y Sustentabilidad Agrícola en el Trópico).- Colegio de Postgraduados, 2017.

La identificación molecular de bacterias cultivables, asociadas a hojas de arroz con síntomas de tizón, mostrará la diversidad microbiana presente en la variedad Aztecas, lo cual será útil para comprender la interacción de este cultivo y su microbiota. Se colectaron plantas de arroz con síntomas de tizón foliar en el municipio de Escárcega, Campeche, de las cuales se aislaron y purificaron 45 bacterias. Las características morfológicas y apariencia de las colonias revelaron 14 morfotipos diferentes; además el 82.6% de los aislamientos fueron bacterias Gram negativas y el restante 17.4% Gram positivas. La identificación mediante la secuenciación del gen 16S rDNA mostró que las especies del género Pantoea sp. y Pseudomonas sp. representaron el 55.4% del total de los aislamientos. Otras bacterias presentes fueron especies del género Enterobacter con el 15.5%, Bacillus, con 11.1% y el género Leclercia, con el 6.6%, así como Exiguobacterium acetylicum, E. indicum, Escherichia hermanni, Microbacterium sp. y Serratia nematodiphila. Además el 22% de los aislamientos fueron identificados como potenciales patógenos, que se dividieron en dos grupos. El grupo 1 con un modo de acción lento en el desarrollo de los síntomas, conformado por Enterobacter sp., E. indicum, Pantoea ananatis, Pantoea sp. y S. nematodiphila; y el grupo 2 con un modo de acción rápido conformado por Enterobacter sp., Pantoea dispersa, Flavimonas oryzihabitans, P. parafulva, y P. taiwanensis. _______________ MOLECULAR IDENTIFICATION OF CULTIVABLE BACTERIA ASSOCIATED TO RICE LEAVES (Oryza sativa L.) WITH BLIGHT SYMPTOMS IN THE MUNICIPALITY OF ESCARCEGA, CAMPECHE. ABSTRACT: Molecular identification of cultivable bacteria, associated at rice leaves with blight symptoms, will show the microbial diversity present in the Aztecas variety. It will be useful to understand the interaction of this culture and its microbiota. Rice plants with leaf blight symptoms were collected in the municipality of Escárcega, Campeche. 45 bacteria were isolated and purified. The morphological characteristics and appearance of the colonies revealed 14 different morphotypes; in addition, 82.6% of the isolates were Gram negative bacteria and 17.4% Gram positive bacteria. Identification of bacteria by sequencing the 16S rDNA gene, showed that the species of the genus Pantoea sp. and Pseudomonas sp. represented 55.4 % of total isolates. The genus Enterobacter was present with 15.5%, Bacillus with 11.1%, and the genus Leclercia with 6.6%, as well as Exiguobacterium acetylicum, E. indicum, Escherichia hermanni, Microbacterium sp. and Serratia nematodiphila. In addition, 22% of the isolates were identified as potential pathogens, which formed two groups, group 1 with a slow mode of action in the development of symptoms, consisting of Enterobacter sp., E. indicum, Pantoea ananatis, Pantoea sp. and S. nematodiphila; And group 2 with a mode of rapid action conformed by Enterobacter sp., Pantoea dispersa, Flavimonas oryzihabitans, P. parafulva, and P. taiwanensis.

Publish date

June, 2017

Publication type

Master thesis

Information Resource

Format

application/pdf

Language

Spanish

Audience

General public

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