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Efecto de la expresión ectópica y del silenciamiento del elF3f en células de adenocarcinoma pulmonar humano (A549)

Ana Edith Higareda Mendoza (2010)

Instituto de Investigaciones Agropecuarias y Forestales. Instituto de Investigaciones sobre los Recursos Naturales. Instituto de Investigaciones Químico Biológicas. Facultad de Biología. Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia. Facultad de Químico Farmacobiología. Programa Institucional de Doctorado en Ciencias Biológicas

In the present work we investigated the down and up-regulation of the function of the gene coding for the subunit f of the eukaryotic initiation factor 3 (eIF3f) and evaluated its cellular effect. The eIF3f gene plays an important role in the initiation of translation (Benne y Hershey 1978). We originally found that the transcriptional expression of the common bean (Phaseolus vulgaris) eIF3f gene was related to cell division. Laboratory results showed that expression of the eIF3f bean gene in meristematic tobacco cells TBY-2 is circumscribed to the G2/M transition of the cell cycle, and that it is essential for the progression of the cell cycle. Recent results suggest that eIF3f is a negative regulator of translation and has a role in apoptotic signaling (Shi et al. 2006). Therefore, it was interesting to investigate if deregulation of eIF3f expression had an effect on human cell proliferation. We investigated the effect of ectopic expression and silencing of eIF3f gene on cellular growth of a human lung adenocarcinome (cell line A549) with the objective of gathering evidence that indicated its importance in cell division and its possible use in gene therapy against cancer. We found that in quiescent cultures, arrested in G0 by serum limitation, the levels of expression of eIF3f are lowered, compared to proliferating cultures. To determine the expression profile of human eIF3f gene during the cell cycle, A549 cells were synchronized and samples were taken after arrest release (mitotic index, RNA and protein). Expression profiles of both the mRNA and the protein of human eIF3f showed the same cyclic outline.

El presente trabajo consiste en alterar, a través de su silenciamiento y sobre-expresión, la función del gen eIF3f (subunidad f del factor eucarióntico de iniciación 3) y evaluar su efecto celular. El gen eIF3f forma parte del complejo multiproteico eIF3, el cual tiene una función importante en el inicio de la traducción (Benne y Hershey 1978). Originalmente se observó que la expresión transcripcional del gen eIF3f de frijol (Phaseolus vulgaris) estaba relacionada a la división celular (Llanderl-Mendoza 2003). Resultados del laboratorio mostraron que la expresión del gen eIF3f de frijol en células meristemáticas de tabaco TBY-2 está circunscrita a la transición G2/M del ciclo celular, y que es esencial para la progresión del mismo (Llanderal-Mendoza 2003). Resultados recientes sugieren que es un regulador negativo de la traducción y que tiene una función en la señalización apoptótica (Shi et al. 2006). Por lo anterior, se consideró interesante investigar si cambios en los niveles de expresión del gen eIF3f tiene un efecto sobre la proliferación de células humanas. Se investigó el efecto de la expresión ectópica y del silenciamiento del gen eIF3f sobre el crecimiento de células provenientes de un adenocarcinoma pulmonar de humano (línea celular A549), con el fin de reunir evidencia que indiquen su relevancia en la división celular y su posible uso en terapia génica contra el cáncer. Se encontró que, en cultivos quiescentes, bloqueados en G0 por limitación de suero, los niveles de expresión del gen eIF3f están abatidos, en comparación con cultivos en crecimiento.

Doctoral thesis

CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA IIQB-D-2010-0003 Sobre-expresión Gen Complejo multiproteico

Análisis de los patrones de respuesta de grupos germoplásmicos y ambientes, por “biplots” en maíz

HUMBERTO DE LEÓN CASTILLO ALFREDO DE LA ROSA LOERA DANIEL SÁMANO GARDUÑO (2003)

"Tener información de las relaciones existentes entre los diferentes grupos germoplásmicos, así como de sus áreas de adaptación y su respuesta a la interacción genotipo x ambiente son herramientas esenciales en la toma de decisiones dentro de los diversos programas de mejoramiento. Este trabajo tuvo por objetivos (i) probar que tres grupos germoplásmicos de amplia utilidad en el programa de mejoramiento de la región ecológica del Bajío, exhiben diferente potencial en la variable de mayor interés económico, el rendimiento, (ii) hacer un análisis del comportamiento de cinco ambientes por su capacidad para, representar el área de interés y para discriminar los genotipos en evaluación, y (iii) estudiar los patrones de respuesta de los grupos, los ambientes y su interacción. Para probar la hipótesis de que los grupos germoplásmicos tienen diferente potencial para rendimiento, se efectuó un análisis de varianza (ANVA); la comparación de los ambientes y el estudio de la respuesta a la interacción genotipo ambiente se realizó mediante el empleo de los modelos multiplicativos “Regresión en los Sitios” y “Efectos Principales Aditivos y la Interacción Multiplicativa”. Los resultados demostraron estadísticamente que los grupos y los ambientes difieren en comportamiento para el potencial de rendimiento; los modelos multiplicativos permitieron una clara clasificación de los ambientes y del estudio de la interacción; el grupo germoplásmico de mayor potencial y menos interacción es el Ideotipo; la localidad más eficiente en la discriminación de genotipos fue Celaya."

"To have information, of the existent relationships among the different germoplasm groups as well as of their areas of adaptation and their response to the genotype x environment interaction are essential tools for taking decisions inside the diverse programs of improvement. This work had for objectives (i) to prove that three germoplasm groups of wide utility in the program of improvement of the ecologic region the Bajio, exhibit different potential in the variable of more economic interest, the yield, (ii) to make an analysis of the performance of five environments for their capacity to represent the area of interest and to discriminate against the genotypes in evaluation, and (iii) to study some response patterns of the groups evaluated in five environments and their interaction. In order to prove the hypothesis that the germoplasm groups have different potential average for yield, a variance analysis was made; the comparison of the environments and the study of the response to the interaction environments x genotype were made using the multiplicative models "Regression in the Sites" and "Additive Main Effects and Multiplicative Interaction.The results demonstrated statistically that the groups and the environment differ in performance for the yield potential; the multiplicative models allowed a clear classification of the environments and of the study of interaction; the germoplasm group of more potential and less interaction is the “Ideotipo”; the most efficient environment in the discrimination of genotypes was Celaya."

Article

Zea mays Modelos multiplicativos Instituto Mexicano del Maíz Germoplasma CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Parámetros genéticos y desarrollo de radícula en maíces poliembrónicos

JOSÉ MANUEL ALCALÁ RODRÍGUEZ (2009)

"La raíz es un órgano esencial en el desarrollo y producción de los cultivos agrícolas. Por tiempo prolongado los fitomejoradores han enfocado su atención en las cualidades aéreas de las plantas y han ignorado el desarrollo del sistema radical; esto debido en parte a la dificultad de observar el desarrollo de la raíz bajo condiciones naturales. Por otro lado, el desarrollo de variedades de maíz de alto rendimiento es un proceso largo y costoso; esto hace que los fitomejoradores busquen o exploren métodos rápidos y accesibles que involucren el comportamiento de genotipos durante etapas tempranas de desarrollo, los cuales ayuden a predecir el establecimiento y producción de híbridos sobresalientes. En concordancia con lo anterior, este trabajo de investigación propone el estudio de nueve genotipos de maíz evaluados en tres diferentes etapas de desarrollo: el primero corresponde a un estudio histológico de radícula de tres días post-germinación; el segundo aborda características de plántula a los 21 días de edad bajo condiciones de invernadero; y el tercero califica el comportamiento productivo de estos genotipos en estado adulto, en dos localidades de prueba. Los nueve genotipos utilizados se describen como sigue: tres poblaciones de maíz con características especiales i.e. dos de ellas poseen alta frecuencia poliembriónica (PE), denominadas NAP o C (normal de alta poliembrionía) y BAP o D (braquítica de alta poliembrionía), ambas generadas en el Instituto Mexicano del Maíz “Dr. Mario E. Castro Gil” (IMM) en Saltillo, Coah. México; la tercera población, exótica a las dos primeras, abiertamente No-PE, denominada Tuxpeño (E), muestra otorgada por CIMMYT, y que cuenta entre sus principales características el alto contenido de aceite en grano; los otros seis genotipos se refieren a las cruzas directas y recíprocas entre las tres poblaciones, generadas de acuerdo al método I de los diseños dialélicos de Griffing (1956). La aplicación de éste, permitió estimar parámetros genéticos como aptitud combinatoria general y específica, efectos recíprocos y heterosis. El desarrollo del primer experimento permitió observar la aparición de radícula en todos los genotipos; esto permitió también documentar la presencia de radículas individuales y múltiples por semilla en las poblaciones PE y los genotipos híbridos generados al cruzarse entre ellas. La frecuencia PE y de radículas múltiples se presentó en el orden de 60 % y 14% respectivamente; mas esta característica se perdió por completo en híbridos F1 con Tuxpeño, viii manifestándose de este modo la PE como un carácter recesivo. Las variables relativas al estudio histológico longitudinal (número de primordios de radícula y longitud de células corticales) y transversal (número de capas del córtex), se vieron favorecidas por la hibridación entre genotipos PE y E. En específico, los mejores genotipos en estas variables fueron los híbridos D x E y C x E, en tanto, para el número de metaxilemas, la combinación C x D resultó ser la más sobresaliente. En este estudio, se logró documentar al menos tres diferentes versiones en la formación de radículas múltiples individualizadas o con cierto grado de fusión exclusivos de genotipos PE. En el estudio de plántula de 21 días de edad, se validó el fenómeno de radículas múltiples influido por la poliembrionía (PE), observándose en proporciones de 7 a 18%; mientras que la frecuencia de la PE se presentó en el orden de 62%. Adicional a esto, se corroboró que la PE se comporta como carácter recesivo en F1. A la edad señalada, los genotipos alcanzaron diferente estado de desarrollo (V3 y V4); la mayoría de las variables estudiadas mostraron que las hibridaciones de PE con Tuxpeño resultaron ser las más eficientes. La producción de materia seca radical solo representó el 60% del aporte total de la parte aérea de los genotipos en general; por tal motivo la condición de dos radículas y número de tallos presentes por plántula en maíces PE, no confirió ventaja aparente en esta etapa de desarrollo. El estudio de comportamiento productivo en plantas adultas permitió establecer que los genotipos No-PE mostraron mejor comportamiento agronómico, por arriba de los PE en las dos localidades de evaluación; estas características se vieron reflejadas en precocidad, menor acame de raíz y, por ix ende, mayor rendimiento de mazorca. Los genotipos de mejor respuesta en esta etapa de evaluación fueron C x E y D x E. La estimación de parámetros genéticos en las tres etapas de estudio permiten señalar que los efectos genéticos aditivos se presentaron sólo en la variable longitud de células corticales LCC (primer estudio), número de hojas NH (en segundo estudio), y para todas las variables agronómicas (ensayo de producción); en tanto, los efectos recíprocos se presentaron en número de células corticales NCC, número de metaxilemas (NMX), peso seco de raíz (PSR) y peso seco de parte aérea (PSPA). La población E resultó el mejor genotipo para heredar características en etapa de plántula y características agronómicas por sus valores de ACG. Los híbridos con los mayores estimados de ACE fueron C x E y D x E, mismos que presentaron los mejores estimados de heterosis en la mayoría de las características estudiadas en las tres etapas de evaluación. La correlación de caracteres estudiados en las tres etapas de desarrollo mostró una asociación inconsistente entre variables; sin embargo, se registró correlación positivas y negativa baja pero significativa en plántula de 21 días en cuanto a número de hojas (NH) con todas las variables agronómicas. Esto indica que un buen establecimiento de plántula pudiera tener una influencia determinante en el desarrollo del cultivo, rendimiento incluido. Los genotipos C x E y D x E presentaron el mejor comportamiento a través de las tres etapas de evaluación."

"The root is an essential organ in crops development and production in agriculture. For many years plant breeders have focused their attention to the canopy part and ignored the development of the radical system, this because of the difficulty of observing the root development under natural conditions. On the other hand, the development of high yield maize varieties is a long and expensive process. However, this can be seen as an opportunity to explore quick and accessible methods where the evaluation of genotypes in early stages of development can help to predict the establishment and production of outstanding hybrids. In agreement with all of that, this research work proposes the evaluation of nine maize genotypes in three different developmental stages: the first one corresponds to a histological study of radicle of three days postgermination; the second undertakes the evaluation of seedlings traits at 21 days of age under greenhouse conditions; and the third stage refers to run two performance assays for agronomical evaluation of the genotypes under study, two locations. The nine maize genotypes used are described as follows: three populations with special characteristics i.e. two of them have the polyembryony mutant in high frequency (PE), named here as NAP or C (normal height, high polyembryony) and BAP or D (brachytic, high polyembryony), both generated in the Instituto Mexicano del Maíz Dr. Mario E. Castro Gil" (IMM) in Saltillo, Coahuila, México; the third is a No-PE population, exotic to the former two, and named as Tuxpeño (E) a high oil corn material which was provided by CIMMYT. The other six genotypes were the resulting direct and reciprocal crosses among the former three populations, using a diallel mating design equal to the Griffing (1956) method I. The application of this method, allowed to estimate genetic parameters as general and specific ability, reciprocal effects and heterosis. The first experiment allowed the observation of radicle appearance at all the nine genotypes at the stage of three days of age; it was also possible documenting the presence of individual and multiple radicles per seed in the PE populations and the hybrids generated among them. The PE and the multiple radicles frequencies in F1 progenies from hybrids between crossings among C and D populations were 60 % and 14% respectively; however, both characteristics were completely absent in the F1 hybrids derived from crossings between C or D with Tuxpeño, supporting previous evidences of the recessive nature of PE. The related variables to anatomic and histological traits such as radicle primordium number and length of cortical cells and also traverse layer cortical number, were favored by the hybridization among genotypes PE and E. Specifically, the best genotypes in these variables were the hybrid D x E and the C x E, meanwhile, for the metaxilemas number, the combination C x D was the highest. In this study, it was remarkable that the PE seedlings showed two to three radicles, ones were fully separated and others were joined partially or completely. The results from the experiment with seedlings of 21 days validated that the multiple radicles phenomena was influenced by PE, and it was found in proportions from 7 to 18%, meanwhile the PE frequency was shown in the order of 62%. It was also confirmed that the PE behaves as recessive trait in F1. At this age, the genotypes reached different developmental stages (V3 and V4), most of the studied variables showed that the hybridizations of PE genotypes with Tuxpeño turned out to be the most efficient. In general, it can be said that radical dry matter represented only 60% of the total canopy dry mater weight in all genotypes, what for the condition of two or more radicles and multiple plumules per seedling in PE maize did not confer apparent advantage at this developmental stage. The two yield performance assays allowed to settle down that the Not-PE genotypes showed a better agronomic performance compared to the PE genotypes, in regard to precocity, minor root logging, and higher ear yield. The superior performance genotypes at this stage were C x E and D x E. The estimates of genetic parameters in the three study lead to state that the genetic additive effects were presented only in the variable cortical cells length LCC (first study), leaves number NH (second study), and for all the agronomic traits (third study), while the reciprocal effects were presented in cortical cells number NCC, metaxilemas number (MXN) and dry root weigh (PSR) and canopy dry weight (PST). The E population was the best genotype to inherit characteristic in both seedling stage and agronomic traits given its ACG values. The hybrids with the best ACE values were C x E and D x E, and also the better heterosis values in most of the characteristics studied in the three evaluation stages. The correlation coefficients obtained along experiments showed an inconsistent association among variables; however, it was calculated a low but significant positive and negative correlation between seedlings leaves number (NH) with all the agronomic traits. This may indicates that a good seedlings setting leads to a better crop development, yield included. The genotypes C x E and D x E presented the best performance throughout the three evaluation stages."

Master thesis

Zea mays L. Poliembrionía Radículas múltiples por semilla CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Desigualdad en hogares con adultos mayores en México, 2015

SERGIO CUAUHTEMOC GAXIOLA ROBLES LINARES DANIEL LOZANO KEYMOLEN (2020)

Archivo digital del artículo

El objetivo de este artículo es analizar la desigualdad entre los hogares con adultos mayores en México en el año 2015. La fuente de información es la Encuesta Intercensal 2015 del Instituto Nacional de Estadística y Geografía (INEGI). La propuesta metodológica de esta investigación se basa en la aplicación de un Análisis de Correspondencia Múltiple que permite estudiar la relación entre las variables de los hogares con adultos mayores en México con base en tres dimensiones: individual, hogar y contexto. Los resultados indican la presencia de desigualdades permanentes entre los hogares con personas con 60 años o más, además de diferencias importantes en los bienes, la estructura familiar y las ayudas gubernamentales, lo que impacta en las condiciones de vida de los adultos mayores de México en 2015.

Article

Hogares con adultos mayores Desigualdad México Análisis de correspondencia múltiple CIENCIAS SOCIALES

All-fiber multimode interference micro-displacement sensor

José Javier Sánchez Mondragón (2013)

We report an all-fiber micro-displacement sensor based on multimode interference (MMI) effects. The micro-displacement sensor consists of a segment of No-Core multimode fiber (MMF) with one end spliced to a segment of single mode fiber (SMF) which acts as the input. The other end of the MMF and another SMF are inserted into a capillary ferrule filled with index matching liquid. Since the refractive index of the liquid is higher than that of the ferrule, a liquid MMF with a diameter of 125 μm is formed between the fibers inside the ferrule. When the fibers are separated this effectively increases the length of the MMF. Since the peak wavelength response of MMI devices is very sensitive to changes in the MMF’s length, this can be used to detect micro-displacements. By measuring spectral changes we have obtained a sensing range of 3 mm with a sensitivity of 25 nm mm−1 and a resolution of 20 μm. The sensor can also be used to monitor small displacements by using a single wavelength to interrogate the transmission of the MMI device close to the resonance peak. Under this latter regime we were able to obtain a sensitivity of 7000 mV mm−1 and a sensing range of 100 μm, with a resolution up to 1 μm. The simplicity and versatility of the sensor make it very suitable for many diverse applications.

Article

Sensors MMI Multimode interference Multimode fiber Fiber sensor Micro-displacement CIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA FÍSICA ÓPTICA ÓPTICA

Generating photon-encoded W states in multiport waveguide-array systems

Héctor Manuel Moya Cessa (2013)

We propose a versatile approach for generating multipartite W states in predesigned on-chip multiport photonic lattices. It is shown that is possible to produce photon-encoded W states where exactly one photon is coherently “shared” among N optical modes by judiciously adjusting the coupling coefficients involved in one-dimensional arrays of evanescently coupled single-mode waveguides. Two-dimensional waveguide configurations are also investigated as possible avenues to produce W states with equal probability amplitudes and equal relative phases.

Article

Nonclassical states Quantum state engineering Multiphoton processes Fabrication techniques CIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA FÍSICA ÓPTICA ÓPTICA

Design of a pressure sensor of 0–7 bar in fiber optic using MMI methodology

VICTOR IVAN RUIZ PEREZ José Javier Sánchez Mondragón (2013)

This research shows the possibility of measuring pressure in the range of 0–7 bar and the comparison against 2 commercial sensors. The technique used is based on the multimodal interference in a fiber optic singlemode–multimode–singlemode (SMS) to 1550 nm. The fiber optic is mounted on a plate of stainless steel AISI 316, where the bending of the plate will generate a curvature on the part of the multimodal fiber generating a decoupling of modes and this generates a low intensity to the output of the system.

Article

FOPS Diaphragm Multimode interference Bending Alternative CIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA FÍSICA ÓPTICA ÓPTICA

Diseño e instrumentación de un sistema de recepción OFDMA en plataforma FPGA

JUAN CARLOS GUTIERREZ ORTEGA (2016)

"Este documento presenta un trabajo de tesis que tuvo como finalidad el diseño e implementación de un sistema OFDMA (Acceso Múltiple por División Ortogonal de Frecuencia) basado en el estándar IEEE 802.16. En la primera parte del trabajo se presenta una descripción general de dicho estándar, en donde se incluyen varios conceptos y definiciones que son necesarias para comprender el funcionamiento del protocolo. Con ello, se pretende establecer los conocimientos básicos y necesarios, para facilitar la descripción de la metodología empleada en el diseño de la solución planteada en este trabajo. En la segunda parte del trabajo se presenta el desarrollo y simulaciones de los diferentes bloques que componen un sistema básico de transmisión y recepción OFDMA realizadas con el software MATLAB, en donde se muestran los diagramas que describen el código implementado y los resultados obtenidos en cada etapa de la transmisión. Después de haber obtenido un primer diseño de los bloques que conforman al sistema OFDMA a nivel simulación en el software MATLAB, se llevaron los programas realizados a nivel hardware. Donde la implementación del sistema se realizó en plataforma FPGA, en esta parte del trabajo se describen los bloques desarrollados mediante el software QUARTUS II. Por último se presentan los resultados de pruebas realizadas al sistema tanto a nivel simulación con el software QUARTUS II, como con el dispositivo físico. En las simulaciones con QUARTUS II se buscó exponer el correcto funcionamiento de los bloques del receptor, en donde se verificó que el receptor recuperara la información enviada del transmisor. Seguido de la comprobación del correcto funcionamiento a nivel simulación del sistema, se realizaron pruebas físicas, primero con un FPGA y después dividiendo el transmisor y el receptor".

Benemérita Universidad Autónoma de Puebla

Master thesis

Multiplexación por división de frecuencia ortogonal Circuitos de matriz de puerta Matrices de puertas programables INGENIERÍA Y TECNOLOGÍA