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Diagnosis of digestive functional disease by the statistics of continuous monitoring of esophageal acidity

ROGELIO RIVERA LANDA EDUARDO CARDENAS CARDENAS RUBEN YVAN MAARTEN FOSSION MARIO ULISES PEREZ ZEPEDA (2015)

Los avances tecnológicos en los últimos decenios permiten el seguimiento de muchos observables fisiológicos de una manera continua, que en la física se llama una "serie de tiempo". La serie de tiempo fisiológico más estudiada es la del ritmo cardíaco, que puede derivarse de un electrocardiograma (ECG). Los estudios han demostrado que un corazón sano se caracteriza por una serie de tiempo complejo y alta variabilidad de la frecuencia cardíaca (VFC). En condiciones adversas, la serie crónica cardiaca degenera hacia la aleatoriedad (como se ve en, por ejemplo, la fibrilación) o la rigidez (como se ve en, por ejemplo, el envejecimiento), ambos que corresponden a una pérdida de HRV tal como se describe por, por ejemplo, Golberger et. Al [1]. Los ritmos cardíaco y digestivo son regulados por el sistema nervioso autónomo (ANS), que consiste en dos ramas antagónicas, la rama ortosimpática (ONS) que acelera el ritmo cardiaco, pero desacelera el sistema digestivo, y la marca parassimpática (SNP) sentido contrario. Debido a esta razón, se podría esperar que las estadísticas de las series de tiempo gastro-esofágico, como describe Gardner et al. Alabama. [2, 3], refleja el estado de salud del sistema digestivo de manera similar a la VFC en el caso cardíaco, descrito por Minocha et al. Alabama. En el presente proyecto, aplicamos métodos estadísticos derivados del análisis de HRV a series temporales de acidez esofágica (pHmetría 24h). El estudio se realiza a partir de datos de una gran población de pacientes del Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán. Nuestro enfoque está en los pacientes con enfermedad funcional (síntomas pero sin daño anatómico). Encontramos que los enfoques estadísticos tradicionales (por ejemplo, el análisis espectral de Fourier) son incapaces de distinguir entre diferentes degeneraciones del sistema digestivo, como la enfermedad de reflujo gástrico esofágico (ERGE) o trastorno gastrointestinal funcional (FGID).

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CIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA Física Física teórica Enfermedades del sistema digestivo (diagnóstico) Enfermedades gastrointestinales Enfermedades esofágicas Enfermedades del corazón (diagnóstico) Control de la frecuencia cardiaca Electrocardiografía Physics Digestive system disease (diagnosis) Gastrointestinal disease Esophageal disease Heart disease (diagnosis) Heart rate monitoring Electrocardiography

Random-matrix spectra as a time series

RUBEN YVAN MAARTEN FOSSION GAMALIEL TORRES VARGAS JUAN CARLOS LOPEZ VIEYRA (2013)

Spectra of ordered eigenvalues of finite random matrices are interpreted as a time series. Data-adaptive techniques from signal analysis are applied to decompose the spectrum in clearly differentiated trend and fluctuation modes, avoiding possible artifacts introduced by standard unfolding techniques. The fluctuation modes are scale invariant and follow different power laws for Poisson and Gaussian ensembles, which already during the unfolding allows one to distinguish the two cases.

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CIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA Física Física molecular Espectroscopía molecular Ciencias no lineales Dinámica caótica Physics Molecular physics Molecular spectroscopy Nonlinear sciences Chaotic dinamics

A time-series approach to dynamical systems from classical and quantum worlds

RUBEN YVAN MAARTEN FOSSION (2014)

This contribution discusses some recent applications of time-series analysis in Random Matrix Theory (RMT), and applications of RMT in the statistial analysis of eigenspectra of correlation matrices of multivariate time series.

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CIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA Física Física teorica Teoría cuántica de campos Física nuclear Physics Nuclear physics Quantum theory

Caracterización de hongos entomopatogenos, agentes de control biológico de diaphorina citri

LIVIER GUIZAR GUZMÁN (2013)

"Diaphorina citri Kuwayama (Hemiptera: Liviidae antes Psyllidae)), es de las plagas más importantes de los cítricos por ser vector de la bacteria Candidatus Liberibacter asiaticus, la cual causa la enfermedad llamada Huanglongbing; su presencia en México, representa una seria amenaza para 526 mil hectáreas de cítricos. D. citri es atacada por diversas especies de hongos entomopatógenos, incluyendo a las del género Metarhizium (Ascomycota: Cordycipitales), que son hongos del suelo, patógenos facultativos de insectos de más de 200 especies, incluyendo D. citri. En el presente estudio, en busca de especímenes infectados con hongos entomopatógenos, se colectaron adultos vivosde este insecto en los municipios de Papantla y Tlapacoyan, en el Estado de Veracruz, México, obtenidos de limón persa (Citrus latifolia) y limonaria(Murraya paniculata), las muestras obtenidas se mantuvieron en laboratorio en cámara húmeda. Se detectó e identificó una especie del género Entomophthora Cohn sensu stricto (Entomophthoromycota: Entomophthorales) infectando 1.4% de insectos adultos. D. citri es un nuevo registro de hospedero a nivel mundial para este género de hongos entomopatógenos. Los caracteres utilizados para la identificación y clasificación de especies de los hongos entomopatógenos (Ascomycota: Hypocreales) son ambiguos la mayoría son casi exclusivamente anamórficos, lo que complica definir la diversidad genética intra- e interespecífica. Estudios moleculares recientes han revelado que M. anisopliae es un complejo de especies que contiene al menos nueve diferentes taxones. En este estudio se reporta por primera vez la presencia de M. robertsii en los Estados de Coahuila, Nuevo León, Veracruz y San Luis Potosí y M. brunneum “alterno” en Tabasco, Chiapas, Colima y Tamaulipas, México"

"Diaphorina citri Kuwayama (Hemiptera: Liviidae (before Psyllidae)), is one of the most important citrus pests; such insect is a vector of the bacteria Candidatus Liberibacter asiaticus, which is the puntative agent of the disease called Huanglongbing. Its ocurrence to Mexico, represents a serious threat to526 000 hectares of citrus. D. citri is attacked by various species of entomopathogenic fungi, including the genus Metarhizium (Ascomycota: Codycipitales), which is a soil fungus, and insect pathogen of over 200 species, including D. citri. In the present study, live adults of this insect living in the municipalities of Papantla and Tlapacoyan, in the State of Veracruz, Mexico were collected for infection with entomopathogenic fungi, obtained from Persian lime (Citrus latifolia) and orange Jasmine (Murraya paniculata), samples were kept in humid chambers in the laboratory. A species of Entomophthora sensu stricto Cohn (Entomophthoromycota: Entomophthorales) was detected and identified infecting 1.4% of adult insects. D. citri is a new host world record for this genus of entomopathogenic fungus. Characters used for identification and classification of species of entomopathogenic fungi (Ascomycota: Hypocreales) are ambiguous, since most are almost exclusively anamorphic, complicating to define intra- and interspecific genetic diversity. Recent molecular studies have revealed that M. anisopliae is a species complex that contains at least nine different species many morphologically identical. In this study, we report for the first time the presence of M. robertsii in the States of Coahuila, Nuevo Leon, Veracruz and San Luis Potosi and M. brunneum "alternate" in Tabasco, Chiapas, Colima and Tamaulipas, Mexico"

Master thesis

Especies Moleculares Hospederos CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Identificación morfológica y molecular de los fitopatógenos asociados al aguacatero en Michoacán, México

ANSELMO HERNANDEZ PEREZ (2016)

"Michoacán es el principal productor de aguacate en el mundo. Su cultivo se ve afectado por diferentes enfermedades. Por lo anterior el objetivo de este trabajo fue corroborar la presencia de patógenos asociados a la enfermedad de la tristeza del aguacatero. Se muestrearon raíces y suelo de árboles de aguacate con síntomas de la enfermedad en mención y se obtuvieron diferentes aislamientos en medio selectivo PARPH-V8®; la especie se determinó mediante la técnica de PCR. Se determinó la patogenicidad inoculando plántulas de aguacate. Para la evaluación de la tasa de crecimiento se realizó una regresión lineal y un ANOVA, se compararon las medias mediante la prueba Scheffe con el programa estadístico R 3.2. Para el porcentaje de inhibición, los resultados se sometieron a un análisis probit, se sometió a un ANOVA mediante un diseño experimental completamente al azar y se realizó la comparación de medias mediante la prueba de Scheffe, se analizaron los datos en el programa R 3.2. Se obtuvieron diferentes aislados: Phytopythium vexans, Pythium sp. amazonianum, Phytophthora cinnamomi, Mortierella elongata y Fusarium solani. De las pruebas de patogenicidad Phytopythium vexans, Pythium sp. amazonianum, Phytophthora cinnamomi y Mortierella elongata causan la sintomatología de la tristeza del aguacatero. Phytopythium vexans, Pythium sp. amazonianum son más agresivas en tasa de crecimiento y en el medio selectivo PARPH se logra aislar a Phytopythium vexans, Pythium sp. amazonianum. Se concluye que existe un complejo de fitopatógenos asociados a la enfermedad en mención (Phytopythium vexans, Pythium sp. amazonianum, Phytophthora cinnamomi, Mortierella elongata) y se reporta que los Oomicetos aislados son nuevos géneros altamente resistentes al Hymexazol."

Abstract: Michoacan is the main avocado producer state in Mexico and the World. This cultivar undergoes different diseases. The goal of this thesis was to demonstrate the presence of some associated patogens in the sadness disease. Roots and abearing diseasel symptoms avocado trees were samped. Different Isolation were obtained in selective environment named PARPH-V8®; the specie was identified using the PCR technique the pathogenicity was determined by inoculating the avocado seedlings. In order to assess the growth rate a liveal regression an ANOVA were utilized. The different means were compared utilizing the Scheffe test with the statistics program R 3.2. concerning the Inhibition rates, the outcomes were subhected to to a Provit analysis an ANOVA was used by mean of an experiemental design wholly at randon. We compare the different means utilizinga the Sheffe test, and the data coming from program R 3.2 were analyzed. Different isolations were obtained such as Phytopythium vexans, Pythium sp. amazonianum, Phytophthora cinnamomi, Mortierella elongata an Fusarium solani. Deeming the pathogenecity tests we may say that Phytopythium vexans, Pythium sp. amazonianum, Phytophthora cinnamomi and Mortierella elongata cause the symptomology of avocado’s saddness. Phytopythium vexans, Pythium sp. amazonianum are more aggressive koncerning the rate of grounth. In the selective environment PARPh Phytopythium vexans and Pythium sp. amazonianum are isolated. It is concluded that there is a cluster of complex phytopathogens agents linked to the above mentioned illness: Phytopythium vexans, Pythium sp. amazonianum, Phytophthora cinnamomi, Mortierella elongata. His also reported that some isolated Oomicetes are new genders highly resistant to Hymexazol.

Master thesis

Identificación molecular Phytopythium vexans Aguacate CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Reverberation and photoionization estimates of the Broad Line Region Radius in Low-z Quasars

CASTALIA ALENKA NEGRETE PEÑALOZA (2013)

Black Hole Mass estimation in quasars, especially at high redshift, involves use of single epoch spectra with s/n and resolution that permit accurate measurement of the width of a broad line assumed to be a reliable virial estimator. Coupled with an estimate of the radius of the broad line region this yields MMB· The radius of the broad line region (BLR) may be inferred from an extrapolation of the correlation between source luminosity and reverberation derived rBLR measures (the so-called Kaspi relation involving about 60 low z sources). We are exploring a different method for estimating rBLR directly from inferred physical conditions in the BLR of each source. We report here on a comparison of rBLR estimates that come from our method and from reverberation mapping. Our “photoionization” method employs diagnostic line intensity ratios in the rest-frame range 1400-2000 Å (AlIIIλ1860/ SiIII]λ1892, Civλ1549/AlIIIλ1860) that enable derivation of the product of density and ionization parameter with the BLR distance derived from the definition of the ionization parameter. We find good agreement between our estimates of the density, ionization parameter and rBLR and those from reverberation mapping. We suggest empirical corrections to improve the agreement between individual photoionization-derived rBLR values and those obtained from reverberation mapping. The results in this paper can be exploited to estimate black hole masses MBH for large samples of high-z quasars using an appropriate virial broadening estimator. We show that the width of the UV intermediate emission lines are consistent with the width of Hβ, therefore providing a reliable virial broadening estimator that can be measured in large samples of high-z quasars.

Article

Galaxies: active Quasars: general Quasars: emission lines Black holes: physics CIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA ASTRONOMÍA Y ASTROFÍSICA ASTRONOMÍA Y ASTROFÍSICA

Semiclassical statistical theory and computer simulations of confined quantum fluids

VICTOR MANUEL TREJOS MONTOYA (2014)

Among various alternative fuels to gasoline an diesel, hydrogen remains to be a very attractive alternative. Nowadays, several types of porous materials have been extensively studied and tested as potential candidates for storage of hydrogen. On the other hand, the evaluation of an adsorptive process is commonly based in new adsorptive materials nanoporous technologies and predictive models based on equations of state. The great importance of hydrogen, thinking as a green combustible, have increased the searching for more accurate predicting models of thermodynamic properties. Molecular simulations and theoretical approaches are of key importance because the prediction of the adsorption properties over a wide range of temperatures and pressures would reduce the number of time consuming experiments required for performance evaluations. This thesis presents a theoretical analysis of the adsorption of mixtures containing quatum fluids at high pressures and low temperatures. Computer simulations under the Metropolis Monte Carlo scheme and molecular equation of state was the main methodology used in this work. The thesis is integrated in three items: The first step is the development of a semiclassical approach to model quantum fluids using the Statistical Associating Fluid Theory for Potential of Variable Range (SAFT-VR), that can be used to determine thermodynamic properties of quantum fluids. This theory is applied to the prediction of liquid-vapor properties of fluids like molecular hydrogen, neon, deuterium and helium-4. To understand the behaviour of these fluids under connement and their adsorptive properties, in the second part of the thesis a MC simulation study of quantum fluids using semiclassical efective pair potentials is presented. The first and second parts are the basis for the development of a two-dimentional equation of state to predict adsorption isotherms of pure quantum fluids and mixtures of there onto different surface substrates. In all cases: theory, experimental data, and computer simulations were compared.

Doctoral thesis

CLE- Doctorado en Física CIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA FÍSICA QUÍMICA FÍSICA Semiclassical statistical - Theory SAFT-VR. (Statistical Associating Fluid Theory for Potential of Variable Range) Computer simulations Quantum fluids - Thermodynamic properties Molecular simulations Quantum physics

A photonic crystal realization of a phase driven two-level atom

BLAS MANUEL RODRIGUEZ LARA ALEJANDRO ZARATE CARDENAS FRANCISCO SOTO EGUIBAR Héctor Manuel Moya Cessa (2013)

We propose a set of photonic crystals that realize a nonlinear quantum Rabi model equivalent to a two-level system driven by the phase of a quantized electromagnetic field. The crystals are exactly solvable in the weak-coupling regime; their dispersion relation is discrete and the system is diagonalized by normal modes similar to a dressed state basis. In the strong-coupling regime, we use perturbation theory and find that the dispersion relation is continuous. We give the normal modes of the crystal in terms of continued fractions that are valid for any given parameter set. We show that these photonic crystals allow state reconstruction in the form of coherent oscillations in the weak-coupling regime. In the strong-coupling regime, the general case allows at most partial reconstruction of single waveguide input states, and non-symmetric coherent oscillations that show partial state reconstruction of particular phase-controlled states.

Article

Photonic crystals Classical and quantum physics Classical simulation of quantum optics CIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA FÍSICA ÓPTICA ÓPTICA

The Glauber-Sudarshan and Kirkwood-Rihaczec functions

Héctor Manuel Moya Cessa (2013)

It is shown how to write the Kirkwood-Rihaczec quasiprobability distribution as an expectation value of the vacuum state. We do this, by writing the position eigenstates as a ”displacment” of the vacumm. We also give a relation between the Glauber-Sudarshan and Kirkwood-Rihaczec quasiprobability distributions.

Article

Quantum Physics (quant-ph) Quasiprobability distribution CIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA FÍSICA ÓPTICA ÓPTICA

Filosofía de la física: vínculos entre teoría y observación desde la mecánica cuántica y la relatividad desde el descubrimiento del bosón de Higgs

PANIEL OSBERTO REYES CARDENAS (2016)

Paniel Reyes Cárdenas completó sus estudios de maestro en Filosofía y doctor en Filosofía (MPhil y PhD) en la Universidad de Sheffield, Reino Unido. Su tesis investigó el pragmatismo y la metafísica del realismo escolástico en C. S. Peirce. Aunque animado por su interés en la tradición pragmatista, Paniel tiene un amplio interés filosófico. Ha publicado artículos sobre Filosofía de las matemáticas, Metafísica, Filosofía medieval, Filosofía de la religión, Hegel, y sobre todo, Kierkegaard. Ha participado en un importante número de congresos académicos en más de 15 países y es fundador de la Sociedad Mexicana de Metafísica y Filosofía de la Ciencia. También es miembro activo del ChiPhi (Centre for the History of Philosophy) del consorcio de las universidades White Rose (Sheffield, Leeds y Yor de México. Después de hacer un postdoctorado en la Universidad de Nottingham (UK) Paniel se integró como profesor-investigador a la UPAEP, en donde es profesor ordinario de Filosofía del lenguaje y de Filosofía medieval.k) y miembro asociado de la Sociedad Académica Kierkegaard.

Universidad Iberoamericana Ciudad de México

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Filosofía de la física Mecánica cuántica Espacio-tiempo Modelo estándar de la física de partículas Philosophy of physics Quantum mechanics Space-time Standard model of particle physics HUMANIDADES Y CIENCIAS DE LA CONDUCTA