Author: YURI JORGE JESUS PEÑA RAMIREZ

Characterization of chloroplast region rrn16-rrn23S from the tropical timber tree Cedrela odorata L. and de novo construction of a transplastomic expression vector suitable for Meliaceae trees and other economically important crops

LUISA ALHUCEMA LOPEZ OCHOA MAX MIZRAIM APOLINAR HERNANDEZ YURI JORGE JESUS PEÑA RAMIREZ (2015)

The forest tree Spanish cedar (Cedrela odorata L.) is well-known for its high-value timber; however, this species is attacked by the shoot borer (Hypsipyla grandella) during its early years of development, resulting in branched stems and making the plants useless for high-quality wood production. The generation of resistant varieties expressing entomotoxic proteins may be an alternative to pesticide treatments. The use of plastid transformation rather than nuclear transformation should be used because it reduces the risk of transgene dissemination by pollen. Chloroplast transformation vectors require an expression cassette flanked by homologous plastid sequences to drive plastome recombination. Thus, C. odorata plastome sequences are a prerequisite. The rrn16-rrn23 plastome region was selected, cloned, and characterized. When the sequence identity among the rrn16-rrn23 regions from C. odorata and Nicotiana tabacum was compared, 3 inDels of 240, 104, and 39 bp were found that might severely affect transformation efficiency. Using this region, a new transformation vector was developed using pUC19 as a backbone by inserting the rrn16-trnI and trnA-rrn23 sequences from C. odorata and adding 2 independent expression cassettes into the trnI-trnA intergenic region, conferring spectinomycin resistance, the ability to express the gfp reporter gene, and a site that can be used to express any other gene of interest.

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CHLOROPLAST TRANSFORMATION EXPRESSION VECTOR FLANKING REGIONS PLASTOME SEQUENCE TROPICAL TREE BIOTECHNOLOGY BIOLOGÍA Y QUÍMICA BIOLOGÍA Y QUÍMICA

Estructura y diversidad en selva inundable al centro y sur de Calakmul

LIGIA GUADALUPE ESPARZA OLGUIN YURI JORGE JESUS PEÑA RAMIREZ AIXCHEL MAYA MARTINEZ EDUARDO MARTINEZ ROMERO (2017)

Se establecieron nueve sitios en diferentes comunidades del centro y sur del municipio de Calakmul, con la nalidad de describir la estructura y composición de especies arbóreas en la selva inundable (SI), conocida como bajos inundables o vegetación de Ak alches. Se censaron 2 212 individuos, 112 especies y 36 familias. El área basal varío entre 5.6 y 18.2 m<sup>2</sup> ha<sup>−1</sup>, las especies con mayor valor de importancia fueron <em>Coccoloba reflexiflora, Gymnanthes lucida, Haematoxylum campechianum, Manilkara zapota, Matayba oppositifolia, Metopium brownei y Sebastiania adenophora</em>. La mayor similitud se presentó entre los sitios al centro del municipio, la diversidad en los sitios Carlos A. Madrazo, El Carmen II, Josefa Ortiz de Domínguez, Centauro del Norte, Ley de Fomento Agropecuario, Narciso Mendoza, Nuevo Conhuás, Unidad y Trabajo, no mostraron diferencias signi cativas (p < 0.05). La estructura horizontal de la vegetación fue similar en todos los sitios, agrupando la mayor cantidad de individuos, más del 50 %, en las categorías diamétricas de 2.5 a 8.4 cm. La estructura vertical presentó un comportamiento semejante entre sitios, concentrándose el 50 % de los individuos entre los 5 y 10 m. La SI alberga especies que son prioritarias para la conservación, tanto en programas nacionales como internacionales, y dada su importancia por aporte de agua y alimento a la fauna de la región se considera que son áreas en las cuales se deben implementar programas de conservación.

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CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Estructura y diversidad en selva inundable al centro y sur de Calakmul

LIGIA GUADALUPE ESPARZA OLGUIN YURI JORGE JESUS PEÑA RAMIREZ AIXCHEL MAYA MARTINEZ EDUARDO MARTINEZ ROMERO (2017)

Se establecieron nueve sitios en diferentes comunidades del centro y sur del municipio de Calakmul, con la nalidad de describir la estructura y composición de especies arbóreas en la selva inundable (SI), conocida como bajos inundables o vegetación de Ak alches. Se censaron 2 212 individuos, 112 especies y 36 familias. El área basal varío entre 5.6 y 18.2 m<sup>2</sup> ha<sup>−1</sup>, las especies con mayor valor de importancia fueron <em>Coccoloba reflexiflora, Gymnanthes lucida, Haematoxylum campechianum, Manilkara zapota, Matayba oppositifolia, Metopium brownei y Sebastiania adenophora</em>. La mayor similitud se presentó entre los sitios al centro del municipio, la diversidad en los sitios Carlos A. Madrazo, El Carmen II, Josefa Ortiz de Domínguez, Centauro del Norte, Ley de Fomento Agropecuario, Narciso Mendoza, Nuevo Conhuás, Unidad y Trabajo, no mostraron diferencias signi cativas (p < 0.05). La estructura horizontal de la vegetación fue similar en todos los sitios, agrupando la mayor cantidad de individuos, más del 50 %, en las categorías diamétricas de 2.5 a 8.4 cm. La estructura vertical presentó un comportamiento semejante entre sitios, concentrándose el 50 % de los individuos entre los 5 y 10 m. La SI alberga especies que son prioritarias para la conservación, tanto en programas nacionales como internacionales, y dada su importancia por aporte de agua y alimento a la fauna de la región se considera que son áreas en las cuales se deben implementar programas de conservación.

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CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Acidobacteria appear to dominate the microbiome of two sympatric Caribbean Sponges and one Zoanthid

ALEJANDRA PRIETO DAVO INGRID AILEEN O'CONNOR SANCHEZ ADAN JESUS RIVERA DOMINGUEZ CESAR DE LOS SANTOS BRIONES YURI JORGE JESUS PEÑA RAMIREZ (2014)

Marine invertebrate-associated microbial communities are interesting examples of complex symbiotic systems and are a potential source of biotechnological products. Results: In this work, pyrosequencing-based assessment from bacterial community structures of sediments, two sponges, and one zoanthid collected in the Mexican Caribbean was performed.

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MARINE-INVERTEBRATE MICROBIOME 16S RRNA PYROTAGS MEXICAN CARIBBEAN SPONGE-MICROBIOME ZOANTHID-MICROBIOME BIOLOGÍA Y QUÍMICA

Efficient plant regeneration from leaf explants of Solanum americanum

INGRID AILEEN O'CONNOR SANCHEZ ANGEL VIRGILIO DOMINGUEZ MAY MIGUEL ANGEL KEB LLANES TOMAS AUGUSTO GONZALEZ ESTRADA YURI JORGE JESUS PEÑA RAMIREZ (2010)

A very efficient system for direct plant regeneration from in vitro-derived leaf explants of Solanum americanum was developed. S. americanum is a tropical plant with important medical properties. The in vitro procedure that was established consists of (i) induction of shoots from leaf tissue, (ii) elongation of shoots, and (iii) rooting of plantlets. The induction of shoots was achieved on Murashige and Skoog solid medium supplemented with different combinations of zeatin riboside and 1-naphthalene acetic acid or 6-benzylaminopurine and 1-naphthalene acetic acid. The best combination for plant regeneration was MS with 5.7 μM zeatin riboside and 0.11 μM 1-naphthalene acetic acid. In the second step, the shoot clumps were transferred to MS basal medium without plant growth regulators, resulting in the differentiation of most of the shoot initials into well developed shoots. In the third stage, plantlets were efficiently rooted on half-strength MS basal medium supplemented with 58.5 mM sucrose. The rooted plants were established in soil with a 100% success rate. This system can be useful to perform further experiments to obtain transgenic plants of this species as well as for other biotechnological approaches. © 2010 Academic Journals.

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1-NAPHTHALENE ACETIC ACID AMERICAN NIGHTSHADE IN VITRO CULTURE MEDICINAL PLANT SPECIES ORGANOGENESIS SHOOTS REGENERATION ZEATIN RIBOSIDE BIOLOGÍA Y QUÍMICA

Efficient plant regeneration from leaf explants of Solanum americanum

INGRID AILEEN O'CONNOR SANCHEZ ANGEL VIRGILIO DOMINGUEZ MAY MIGUEL ANGEL KEB LLANES TOMAS AUGUSTO GONZALEZ ESTRADA YURI JORGE JESUS PEÑA RAMIREZ (2010)

A very efficient system for direct plant regeneration from in vitro-derived leaf explants of Solanum americanum was developed. S. americanum is a tropical plant with important medical properties. The in vitro procedure that was established consists of (i) induction of shoots from leaf tissue, (ii) elongation of shoots, and (iii) rooting of plantlets. The induction of shoots was achieved on Murashige and Skoog solid medium supplemented with different combinations of zeatin riboside and 1-naphthalene acetic acid or 6-benzylaminopurine and 1-naphthalene acetic acid. The best combination for plant regeneration was MS with 5.7 μM zeatin riboside and 0.11 μM 1-naphthalene acetic acid. In the second step, the shoot clumps were transferred to MS basal medium without plant growth regulators, resulting in the differentiation of most of the shoot initials into well developed shoots. In the third stage, plantlets were efficiently rooted on half-strength MS basal medium supplemented with 58.5 mM sucrose. The rooted plants were established in soil with a 100% success rate. This system can be useful to perform further experiments to obtain transgenic plants of this species as well as for other biotechnological approaches. © 2010 Academic Journals.

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1-NAPHTHALENE ACETIC ACID AMERICAN NIGHTSHADE IN VITRO CULTURE MEDICINAL PLANT SPECIES ORGANOGENESIS SHOOTS REGENERATION ZEATIN RIBOSIDE BIOLOGÍA Y QUÍMICA BIOLOGÍA Y QUÍMICA